身体虽然变小，但头脑一样好，任何难题都能解开的名侦探，真相永远只有一个！
“新一，新……”博士急急忙忙的跑了出来，你要的东西我弄好了。“好的，灰原，穿上。”“嗯。”“事不宜迟，我们现在就出发吧。”
路上
“嘿嘿嘿。”不用说，肯定又是他们三个偷偷上了车。“喂，你们几个，叫你们不要出来，你们为什么就不听？这次可不是去玩。”柯南怒道。
“我们知道了，话说到底是什么事啊？”灰原说：“这次，生化实验室里的病毒消失了，我们的目的地就是因那个病毒而感染的人的村子。”“所以说，你们根本不可以跟来”柯南似乎很生气。“我们会注意的，你就别生气了。”“那你们要答应我的要求。”“什么要求。你尽管说。”
柯南说：“一：你们到了那边，一切要听从博士和我的安排，不可以擅自行动。二：遇到危险要立刻和我说。三：这个穿上。”柯南把博士研究好的防化服给了他们。
“柯南，这是什么？”“这是我让博士研究的防化服，也就是病毒不会对你造成直接的伤害。不过也不等于你就是免疫病毒了。”柯南说道。“阿笠博士研究出来的疫苗只有一支。所以一定要小心。”
“女王陛下，您要的东西我们带来了。”女孩们说道。“很好，你们出去吧。”女王看着地上被打晕了的十几个小女孩，“妹妹……”女王朝着地上的女孩的脖子，疯了一般的咬。
“这样，应该差不多了。”女王看着地上的女孩，再次流下了眼泪。
到了目的地
“就是这里吗？”柯南下了车，嘟囔道。“下车吧，我们去附近问问这里的居民，看看能不能获得什么情报。”
柯南走到一位大哥哥面前：“大哥哥，请问这里是不是发生了什么？”“小弟弟，这里确实发生了不得了的事情，你不要到处说。我告诉你，昨天晚上，我们这个村一个最喜欢冒险的一个年轻人，他晚上总是喜欢去一些比较危险的地方，比如那边的森林或者洞穴之类的。”
“但是就是在前天晚上。”那个大哥哥压低了声音，“他像往常一样出了村子，去了洞穴，第二天还没回来，我们认为也许他想多玩一会儿，可是两天了，一点消息没有，我们就请这里的几个胆大的小伙子和警卫去找，没想到，在洞穴里…”“发生了什么？”柯南迫不及待的问道。“在洞穴里发现了他，起初我们以为他只是想吓我们一跳，他背对着我们，一动不动，我们过去准备叫他走时，他突然向我们扑过来，就像疯了一样，看见人就咬，或者抓，还好警卫带着枪，否则后果不堪设想啊。”大哥哥说着说着，不禁打了个哆嗦。
“怎么会发生这种事情，”柯南沉思了，“不会吧，如果这个推理成立的话，将会有一场大灾难等着我们。”
“博士，今天天色不早了，我们先去找个地方休息，晚上是很危险的。”柯南看了一下手表，说。
“好，就去那边的旅馆吧。”博士指了一下。“好的。”
晚上，大家都熟睡之后，柯南依旧未眠，“要是真是那样，就不该让他们来了，灰原也是。”“大侦探在想什么呢？这么晚了也不休息？”灰原的声音突然响起，把柯南吓了一跳。
“没什么，我在想，我在想，黑色和灰色你更喜欢哪个？”“这个嘛，当然是灰色啦。”灰原想都没想，脱口而出。
第二天
“不会吧，又一个？”居民的声音响了起来。
“哈欠，困死我了。”柯南打了个哈欠。朝刚才叫的那个居民问：“阿姨，你刚才说什么又一个啊？”
“小弟弟，你最好不要知道，快点离开这里，马上这里要被封锁了。”
“啊，为什么？”柯南其实是知道的，但就是想多套出一些情报。
“好吧，我就告诉你。最近接二连三的有小女孩失踪，而且数量多得惊人，三天已经少了近20个了！啊，尤其是你身后的小妹妹，快带她们离开，不然后果你是知道的。”
“阿姨，谢谢你了。”柯南谢了刚才那位阿姨。转身朝灰原和步美走去。
“看来这次挺棘手的，”先是人类发生异常，然后又是小女孩失踪，一串串信息使柯南的头都大了。
“怎么了，柯南，无精打采的，是不是昨晚没睡好？”步美关心的问。
“啊，不是，刚才我去问了那个阿姨，她说最近总是有小女孩失踪，我觉得实在可疑，就在想为什么而已。”柯南说。
“什么！”步美和灰原都吓住了。“不过没关系，我会保护你们的。”柯南似乎信心满满。
“灰原，你过来下。”柯南把灰原拉到一边，“这个手表型*给你，博士说今天改造了，里面有10发，交给你了。你要保护好自己，上面还有卫星系统，可以随时和我联系。”“嗯。”灰原从口袋里拿出备用的追踪眼镜，“有这个就可以啦。”“真拿你没办法。”
吃完早饭后，柯南想出去调查一下。灰原一把拉住了他：“不可以，你想成为下一个实验品吗？”“灰原，我说过了，只有冒险的人生才是有意义的人生，况且，”柯南顿了一下“我是不会轻易死的，我还是舍不得你的。”灰原的手松了开来：“工藤…”
“到底发生了什么，我倒要看看是什么东西在作怪。”柯南一边想着一边在森林里漫步。
起初，他还是一副悠闲的样子，但是到了后来…