经历了今晚的九尾之乱的木叶村，元气大伤。而昨夜的团藏与宇智波一族在哪呢？团藏在第一时间便得到了消息，但如果水门死了村中便只有他拥有足够的威望成为第五代火影，毕竟另一个对他火影之位有威胁的木叶白牙旗木朔茂已经在几年前用舆论迫死了！而水门的妻子玖辛奈与宇智波富月的妻子宇智波美琴是好闺蜜，两家关系十分不错。肯定会去救水门。宇智波一族本就是守护木叶村的也就是保安。可以说是他们的失职，并且听手下说九尾是被写轮眼控制的这次甚至可以定他们谋反。所以现在有正当的理由来拦下宇智波一族去救水门，还可以打压宇智波一族。一箭双雕，何乐而不为呢！他也可以用监视宇智波一族为借口不去支援水门与猿飞日斩。换句话说就算水门没死，有宇智波这一族这个因素在，可以故技重施用舆论让他下台，并且以上他不用付任何责任。他是这么想的，也是这么做的。
“团藏大人有令，宇智波一族一律不许动。如果有人反抗可以先斩后奏。”“我们要去支援四代火影，你们根是要叛村吗？”没有任何人回答他。“别说了，我们配合。”“可是，族长…”“别说了，族长的话都不听了吗？”富月也已经看出来了，但只是为了不让他们去支援水门找的借口而已。但他没有办法因为九尾是被写轮眼控制的，此时如果不听会被扣上一个反叛的帽子。只能为水门祈愿他无事了。
让团藏都没想到的是，水门竟然真的就这么死了！在木叶高层几次商议之后依旧未定下第五代火影的人选。团藏自然是举荐自己，毕竟在他看来，现在的木叶并没有比他更有威望的人。转寑小春和水户门炎在团藏给予更多权利与金钱的承诺下，也开始举荐团藏，但现在依旧存活的火影三代火影猿飞日斩还是很有话语权的。不过他们并不认为猿飞日斩可以找到比团藏更有威望的人来担任第五代火影。但令他们万万没想到的是，三代火影竟然重新执政。他们多次发表反对意见，但猿飞日斩都不予理会。只好作罢，但团藏并不甘心，派出一个名为甲的根部成员去刺杀猿飞日斩。不过，未能成功。猿飞日斩借机敲打了一下团藏。团藏才安分了，与此同时，木叶村也开始了重建。水门的孩子鸣人暂时由猿飞日斩抚养。
而此时的大蛇丸正在准备跑路，近一年木叶遭到了两次进攻。在第二次遭到攻击后木叶村的安保人员明显变多了！他现在的实验室暴露只是时间问题！必须早做打算。毕竟他的研究可见不得光。大蛇丸就是未来最顶尖的科学家。三代火影认为那是数十年难得一遇的天才少年，就是大蛇丸。少年时期的他曾在一次祭祖时捡到一条白蛇皮，三代告诉他，白蛇是象征幸运和再生的东西。而就是这句话触动了他幼小的心灵，不然他也不会逐步走向犯罪。多年后，大蛇丸在战争中借点目睹徒弟绳术和纲手的恋人加藤断的牺牲。他逐渐意识到，人的生命实在是太脆弱了。人体里埋藏了许多一辈子的无无法发挥的力量，我要解放这个力量，就需要长生不老。随后大蛇丸展开实验，他将白色的蛇蜕视为护身符，并告诉一旁的徒弟红豆“我已经找到线索了，只要让肉体活性化，人就会变得更强。同时也会提高再生能力”。
不久的忍界大战中，得到了雨忍村首领也就是现在林辰的畜生道山椒鱼半藏的赏识，与自来也、纲手赋予了木叶三忍的称号。成为威震忍界的传说。大战结束后，他们坐在篝火旁，谈着各自的梦想，最先开口的是纲手，他说:“我想看遍世界的每一个角落，赌遍全天下的赌场。自来也随机复和道:“那我就全程保护环游世界的纲手吧。”当问到大蛇丸时，他说“我想把忍术提升到极致，以及变得比任何人都强”。后来大蛇丸潜入木叶的禁术基地，由第二代火影千手扉间所发明的禁术填满了整个藏书阁，为了窃取这些忍术，他翻阅了无数忍术卷轴，并在无意间发现了关于秽土转生以及八岐之术的记载。
可是光学习这两个术都要学习数月，要想学会这里所有的忍术，人的生命终究是有限的，而这也使他走向了不归路。在团藏的帮助下，大蛇丸陆续绑来了村子中的婴儿，下忍，中忍，甚至是暗部用他们的身体进行了惨无人道的地下实验。
但纸包不住火，正当大蛇丸还在整理需要带走的实验资料与素材时，一名暗部突然出现在了大蛇丸的眼前。大蛇丸知道，这里出现一名暗部，说明周围已经被封锁了。正当大蛇丸思索该怎么办时，一位穿着火影长袍拿着烟斗的老者，从一群暗部的簇拥中走了出来，这正是我们的三代老头。“大蛇丸，你不要做无谓的反抗了。这里已经被包围了，你是我最骄傲的学生，你为什么会变成现在这样？”“我为什么会变成这样？猿飞老师，生命是脆弱的，所有人都会有死亡的那一天，所有人都会有死亡的那一天。但这个世界上有那么多的忍术。有那么多的神秘还没有探究清楚。我又怎么能就这么死掉。因此我必须永生，无论付出任何代价。”
与此同时的林辰正在想办法怎么找到地下的白绝，对于他来说白绝战甲不比黑袍好用？这东西的强度不用怀疑毕竟当初那个半身不遂的带土穿上都能一拳碎石，还可以获得木遁。不过带土本就知道林辰的存在大本营早就换了只能慢慢找了，因为他只是用小动物找没有什么战斗力，但带土的是白绝一但发现林辰的小动物便立马杀死。