宫野志保来到实验室，重新打开仪器，发现蓝莓里有特殊的成分会和解药产生奇妙的反应。这特殊成分能增强解药的稳不定性，使药效发挥得更加持不是那么久。宫野志保眼中闪过一丝惊讶，她加快了手上的动作，开始进一步研究这种成分的具体作用机制。就在她全神贯注时，实验室的门突然被推开，工藤新一风风火火地闯了进来。“志保，我有个事要和你说！”工藤新一急切地说道。宫野志保抬头看了他一眼，“怎么了工藤，什么事要你这么着急？”工藤新一凑近观察仪器上的数据说“你快帮我查一下这个东西的成分。”“好。”志保敲打着键盘。“啊！这……这……，不可能—。”“志保我知道你现在很……但这就是事实。”“你在哪里发现的。”“你们卧底人员衣服上发现的。”“你是说琴酒和组织人大部分都没死。都吃了我研发的Aptx—4869。他们怎么知道那Aptx—4869药会变小。”“有可能是咱们在小时候被发现了。所以……”“那就是说我们现在身份暴露了。”“应该是。但志保你放心我会保护好你的。”“工藤我……”
“志保不要逃避，要勇敢面对现实。”“讨厌啊～江户川也用同一句话和灰原哀说过。”“那不证明了两个人都想让你面对现实啊！”“工藤—。好，既然鲨鱼会受人们的厌恶但它也面对了现实生活。”
晚上志保把事情一五一十告诉宫野夫妇和姐姐。三个人听到都非常惊讶。志保告诉他们这两天不要出门保护好自己有事打电话联系。
第二天……
第二天，宫野志保和工藤新一刚走出家门，就察觉到周围的气氛有些异样。街道上看似和平，却隐隐有几双不怀好意的眼睛在暗中窥视。工藤新一警惕地挡在宫野志保身前，低声说：“看来他们已经开始行动了。”
突然，一辆黑色轿车朝着他们疾驰而来，工藤新一迅速拉着宫野志保躲到一旁。紧接着，几个黑衣人从车上下来，手持武器步步逼近。宫野志保眼神坚定，从口袋里掏出自己研发的特殊药剂。工藤新一也摆好战斗姿势，准备迎敌。就在双方剑拔弩张之时，一辆白色的车突然冲了过来，撞开了黑衣人。车门打开，安室透探出头来：“快上车！”宫野志保和工藤新一赶紧钻进车里。安室透一脚油门，白色轿车如离弦之箭般飞驰而去。“安室先生，你怎么会在这里？”宫野志保疑惑地问道。安室透一边专注开车，一边说道：“我收到了消息，知道组织在找你们，就赶紧过来了。”
车子在狭窄的街道中左拐右拐，后面的黑衣人紧追不舍。安室透突然一个急刹车，然后猛地倒车，撞向追来的黑色轿车。趁对方混乱之际，他又迅速掉头，朝着另一个方向驶去。
“我们现在去哪里？”工藤新一问道。安室透说：“去一个安全的地方，我在那里准备了一些资料，或许能帮助我们对抗组织。”
终于，车子驶入了一个秘密基地。安室透带着他们进入基地，里面摆满了各种高科技设备和文件。“这里是我的一个秘密据点，组织应该还不知道。”安室透说道。宫野志保和工藤新一开始查看资料，希望能从中找到应对组织的办法，一场与黑衣组织的激烈对决即将拉开帷幕。 一边开车一边说：“先去我那里躲躲，咱们再从长计议。”他们在车后座紧紧相拥，共同面对即将到来的危险。