高祖武德七年（甲申，624）
李建成与嫔妃因而一起中伤李世民说："突厥虽然屡次成为我国边境上的祸患，但他们一抢得财物便会退去。秦王在外假托以抵御突厥为名义，实则是想总揽兵权，使他篡位夺权的阴谋能够成功罢了！"
高祖到城南围猎，太子、秦王、齐王都伴驾随行，高祖命三个儿子骑马射取猎物，比赛输赢。李建成有匹产自胡地的烈马，肥大壮实但喜欢尥蹶子，他把这马交给李世民说："这匹马奔驰速度极快，几丈宽的山涧能够一跃而过，二弟善于骑马，骑上去试一试。"李世民骑上胡马来追逐野鹿，马突然跳起后蹄向后踢去，李世民跃立到数步开外，当马重新站好，李世民再骑上它，像这样接连三次。李世民回头对宇文士及说："他想借助这畜生来杀害我，但人的生死都是命中注定的，他能够害得了我什么！"这话被李建成听到了，就让妃嫔在高祖面前诬谄李世民说："秦王亲口说：'我有天命，将成天下之主，哪会无缘无故死去！'"先召来李建成、李元吉二人，然后召入李世民，斥责他说："天子谁做，自有上天授命，不是靠才智和勇力就能谋求的；你也太着急当这个皇帝了吧！"李世民摘下帽子磕头，请求将自已交付司法部门审问验证，高祖的怒气仍没缓解。适逢有关部门上奏突厥入侵，高祖这才变了面孔，开始劝慰勉励李世民，让他把王冠跟腰带整理好，与自己共同谋划对付突厥的方法。闺七月，二十一日，诏命令李世民与李元吉率兵马取道豳州，前去抵御突厥，高祖在兰池给他们饯行。每当有盗寇侵扰，高祖总是命李世民前去讨伐，但当战事平息后，对李世民却越发猜疑了。
高祖武德九年（丙戌，626）
六月，初一，太白经天。
秦王李世民与太子李建成、齐王李元吉之间已有了间隙，他认为洛阳地势险要，恐怕有一天会发生变故，便打算离京入洛阳谋求自保，所以就命行台工部尚书温大雅去镇守洛阳，另派秦王府车骑将军荥阳人张亮带领近侍王保等千余人去往洛阳，暗中结交山东豪杰，等待形势的变化，拿出很多金银布帛，让他们随意使用。李元吉告发张亮图谋不轨，张亮被交给有关官吏拷问。张亮到最后也没有言语，便释放了他，让他返回洛阳。
李建成将李世民在夜里召来，喝酒时用毒酒加害他。李世民突然间心口特别疼痛，连吐几升血，淮安王李神通将其搀回西宫。高祖赶到西宫，询问李世民的病况，命令李建成说："秦王向来不能喝酒，今后禁止你跟他在夜间饮酒。"因而对李世民说："首先谋划反隋大计，并铲平国内的敌人，都是你的功劳。我原先想要将你立为太子，你却一再推辞。而且，建成年纪最长，作为太子的时间也很长了，我实在不忍心将他废黜。我看你们兄弟好像难以相容，你们二人同处京城，定会纷争，我应当派你返回陕东道行台，留居在洛阳，陕州以东地区都奉你为王。我还要让你建立天子旌旗，就同汉梁孝王的先例。"李世民哭泣起来，以不想远离高祖膝下作为推辞。高祖说："天下本是一家。洛阳和长安两地，路途很近，我想你了就会去看你，你无需太过悲伤。"李世民将要出发时，李建成和李元吉一同计议说："秦王若到了洛阳，拥有土地甲兵，便再也不能控制住他了。不如把他留在长安，这样他就仅是一个匹夫罢了，拿下他也就很轻松了。"于是，他们暗中让数人给高祖呈上密封的奏章，声称："秦王左右亲信得知秦王将要去洛阳，没有不欢喜雀跃的。看李世民的志向，恐怕他是不会回来了。"又派高祖宠信的臣子以秦王去留的利害关系来对高祖进行劝说，高祖于是改变了主意，李世民去洛阳一事便又中止了。
李建成、李元吉与后宫的尹德妃、张婕妤等嫔妃日夜不停地向高祖中伤李世民，高祖相信了，将要惩处李世民。陈叔达进谏说："秦王为国家立下了大功，不能废黜。况且，他性情刚烈，若对其加以摧挫抑制，恐怕他敌不过内心的悲愤忧郁，一旦他染上难以意料的疾病，陛下就算是后悔也来不及了！"高祖这才没有对李世民进行惩处。李元吉暗中请求杀掉秦王，高祖说："他有平定天下的功劳，而且他的罪状也并不明显，拿什么当借口呢?"李元吉说："秦王当初平定洛阳时，观望大势走向，不愿回朝，还散发钱财布帛来树立私人的恩德，又违背陛下的命令，这不是造反又是什么！就应该速度将他杀掉，还担心找不到借口吗！"高祖没答应。
秦王府所属的官员都很担忧害怕，不知道该怎么办。行台考功郎中房玄龄对比部郎中长孙无忌说："如今仇怨已经形成，一旦祸患暗中爆发，岂止是秦王府一家一败涂地，实际上这是在给国家制造忧患。不如劝说秦王效仿周公诛灭管叔与蔡叔的行动，以安定国家。存亡的时机，情势危急，容不得半点瑕疵，关键时刻就在今日！"长孙无忌说："我早就怀有这个想法了，只是不敢开口。今天你说的这番话，正合我心。应当把您的话转述给秦王听。"于是进府告诉了李世民。李世民召房玄龄前来商议此事，房玄龄说："大王的功劳天下第一，应当继承帝皇勋业。现在大王所怀有的忧虑惶惧，正是上天赐予的帮助。希望大王不要迟疑。"又与秦王府属官杜如晦一起劝说李世民诛杀李建成、李元吉。
李建成与李元吉知道秦王府内有很多骁勇的将领，便想把他们利诱过来为己所用，就暗中把一车金银器物赠给了左二副护军尉迟敬德，并且在书信招揽他说："愿您能够屈驾眷顾，来加深我们之间的我们之间的交情。"尉迟敬德推辞说："敬德，是从用蓬草编门，用破瓮做窗的穷苦人家出来的草民，遭逢隋朝末年战乱不止、百姓流离的时局，长期沦落在抗拒朝廷的境地里，罪不容诛。秦王对我有再生之恩，现在我又在秦王府委质为官，只有一死可以报答秦王。我没有为殿下立过半点功劳，不敢平白无故接受如此厚重的赏赐。如果我私自与殿下结交，就是怀有二心，因追求利益而忘掉忠义，殿下要这种人又有什么用呢！"李建成发怒，于是跟他断绝了来往。尉迟敬德把这件事告诉给李世民，李世民说："您的心坚实如同山岳，即使他赠予给您的金子堆积得顶住了星辰，我也知道您是不会有所动摇的。他给您的东西您就收着，这有什么好避险的！况且，这样做也能够得知他的阴谋，这计策难道不高明！不然，祸事就要殃及到您了。"不久，李元吉派遣豪壮勇士趁夜色刺杀尉迟敬德，尉迟敬德得知后，大开层层门户，自己躺在床上安稳不动，刺客虽数次进到他家院子，终究没敢进入卧房。于是，李元吉在高祖面前中伤尉迟敬德，敬德被关进诏狱进行审讯问罪，将要问斩，由于李世民一再为他求情，这才幸免不死。李元吉又中伤左一马军总管程知节，将他外放到康州做刺史。程知节对李世民说："能够辅弼大王的得力干臣都快走光了，大王自己又怎么能够长久呢！我程知节就算是死也不离开京城，希望大王能够及早拿定主意。"李元吉又用金银布帛利诱右二护军段志玄，段志玄不为所动。李建成对李元吉说："在秦王府里的智谋才略之士之中，值得畏惧的唯有房玄龄和杜如晦罢了。"李建成与李元吉又向高祖中伤他们，使他们遭到驱逐。
适逢突厥郁射设率领数万骑兵驻扎在黄河南岸，进入边寨，围住乌城，李建成推荐李元吉代替李世民督率各路军队北上征讨。高祖采纳了，命令李元吉督率右武卫大将军李艺、天纪将军张瑾等人去驰援乌城。李元吉请求让尉迟敬德、程知节、段志玄及秦王府右三统军秦叔宝等人与自己同行，检阅挑选秦王军中的精锐将士，来加强李元吉的军队。率更丞王晊暗中禀告李世民说："太子对齐王说：'你如今已经得到秦王帐下的精兵猛将，坐拥兵马数万。我与秦王在昆明池给你饯行，让勇士把秦王拉进帐幕里杀死，再上奏陛下说他得了急病突然死了，陛下应该不会不信。我